El Sistema de Información Universitaria (SIU) propone e integra a SIU Guaraní la plataforma virtual de aprendizaje Moodle, de código abierto, para la gestión de las clases de las asignaturas a través de la Web.
Por este motivo, en el CeSPI se han extendido los servicios necesarios para su integración con el sistema SIU Guaraní con el fin de permitir la sincronización de inscripciones a cursadas y exámenes finales de los estudiantes con los diferentes cursos virtuales que brinda la plataforma. Asimismo, se han unificado, la identificación del estudiante en Moodle con la del SIU Guaraní a través del Sistema de Acceso Único.
En la actualidad Moodle está se encuentra integrado con SIU Guaraní de las Facultades de Ciencias Veterinarias, Informática, Ingeniería y Ciencias Exactas.